Sin embargo, casi un mes después de partir de Barcelona, la travesía enfrenta tensiones internas, con la salida de su portavoz y la de varios activistas.
Los participantes afirmaron que algunos miembros abandonaron la misión, alegando el impacto físico y mental de los prolongados retrasos y el espacio reducido sumado a que se dieron cuenta que los objetivos de los participantes no son los mismos.
La activista climática sueca Greta Thunberg también abandonó el barco Family y se unió a otro, el Alma. Los organizadores afirmaron previamente que se incendió el Alma tras un ataque con drones, algo que finalmente se desmintió.
Según fuentes presentes en la travesía, Thunberg expresó que “la comunicación se está centrando demasiado en los asuntos internos de la flotilla y no lo suficiente en el genocidio de Palestina”, enfatizando su preocupación por la difusión mediática que busca y no, por ejemplo, en los activistas bailando en medio del viaje de la Flotilla como si fuese un viaje de egresados.
Il dolore, la mestizia, per la grave situazione a Gaza, che traspare tra i partecipanti della #flottiglia , è commovente.#selfie #radicalchic #Flottiglia #FlotillaSumud pic.twitter.com/WtVRqOqTRl
— TELADOIOLANIUS (@TELADOIOLANIUS) September 3, 2025
El Ministerio de Asuntos de la Diáspora de Israel lanzó un sitio web antes de la llegada de la flotilla, acusando a sus líderes de vínculos con Hamás y la Hermandad Musulmana.
El sitio web describe la campaña, denominada Flotilla Global Sumud, como una “iniciativa antiisraelí con raíces terroristas” y presenta un gráfico de presuntas conexiones entre los organizadores de la flotilla y terroristas.
Entre los nombrados se encuentran Marouane Ben Guattaya, activista argelino propalestino fotografiado reuniéndose con el funcionario de Hamás Youssef Hamdan, y Wael Nawar, miembro del comité directivo de la flotilla, quien se ha reunido con representantes de Hamás y la Yihad Islámica.
Según el ministerio, Nawar también asistió al funeral en febrero del exlíder de Hezbolá, Hassan Nasrallah.
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Los organizadores de la flotilla afirmaron que el Alma fue atacado dos veces por drones mientras estaba atracado en Túnez. Reuters informó que se produjo un incendio en el buque, y un video circuló en línea.
La guardia nacional tunecina desestimó posteriormente las acusaciones de un ataque, sugiriendo que un cigarrillo tirado pudo haber causado el incendio, reportó Enlace Judío.
Thunberg publicó un video después del incidente, en el que afirmaba que se encontraba en un puerto tunecino “después de que nuestro barco que transportaba ayuda humanitaria fuera bombardeado”. Los organizadores sostuvieron que el buque resultó dañado por un incendio en la cubierta.